Не знаю поможет этот гайд или нет, но все же пусть висит тут.
Итак, если появились проблемы с запуском программы в 2 окна на Висте.
Выкладываю гайдик что надо отключить чтобы прога заработала, Однако предупреждаю! на своем компе не проверяла ибо стоит ХР!
Чтобы все заработалo надо отключить UAC.

Что это такое?
Контроль учетных записей пользователей – это функция Windows, позволяющая предотвратить несанкционированные изменения в системных файлах компьютера. UAC обеспечивает защиту, запрашивая разрешение или пароль администратора перед совершением потенциально опасных для компьютера действий или при изменении параметров, которые могут оказать влияние на работу других пользователей.

как отключить?
Отключение UAC не означает, что компьютер останется беззащитным, поскольку программы Брандмауэр Windows и Защитник Windows будут по-прежнему работать и выполнять свои обязанности по защите компьютера. А если добавить к ним или, еще лучше, вместо них более профессиональные брандмауэры и антивирусы, то за безопасность вашего компьютера можно будет не беспокоиться, хотя гарантии на 100% от возможных неприятностей не даст как UAC, так и любое другое средство.

1. Щелкните на значке Пуск и введите в строке Начать поиск команду msconfig.
2. В открывшемся окне перейдите на вкладку Сервис, найдите в списке команду Отключить контроль учетных записей и щелкните на кнопке Запуск.
3. Затем перезагрузите компьютер, и служба UAC будет отключена.

4. Чтобы ее включить, достаточно на той же вкладке Сервис утилиты msconfig выбрать команду Включить контроль учетных записей и щелкнуть на кнопке Запуск, после чего перезагрузить компьютер.

ПРЕДУПРЕЖДЕНИЕ: гайд выложен без предварительного использывания, поэтому на 100% не утверждаю что поможет. Делайте на свой риск и страх!
однако ее включит можно точно так же как и отключить, думаю вреда не будет.

После прога на 2 окна(например: PW Client Renamer) должна работать.
С уважением, Бруська.

материал взят с тык